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Wenn du nichts allzu SQL spezifisches bei dir aktuell verwendest (evt. Probleme sind oben aufgeführt) dann sollte es im einfachsten Fall reichen einfach die Dateien mit denen aus der neuen Version zu überschreiben. Hier sollte man jedoch vorher ein Backup zur Sicherheit anlegen und auch nicht einfach wahllos überschreiben. Dateien, welche man nicht einfach überschreiben sollte sind z. B. in ./mysql/data/mysql (hier liegt z. B. deine User DB mit den Rechten) und natürlich die mysql.ini Datei.
Je nach DB Format und Features kann die neue Version aber nicht mit den alten DBs umgehen. Dann hilft am einfachsten alles zu dumpen, neu aufzusetzen und den Dump wieder einzulesen.
